生态农业的缺点
生态农业的缺点：理论基础上不完备，生态农业是一种复杂的系统工程，它需要包括农学、林学、畜牧学、水产养殖、生态学、资源科学、环境科学、加工技术以及社会科学在内的多种学科的支持。
生态农业的缺点包括： 理论基础上不完备：生态农业作为一种复杂的系统工程，需要多种学科的支持，包括农学、林学、畜牧学、水产养殖、生态学、资源科学、环境科学、加工技术以及社会科学等。 技术体系不够完善：生态农业系统中的各个组成成分之间具有复杂的关系。
缺点：理论基础上不完备：生态农业是一种复杂的系统工程，以前的研究，往往是单一学科的，因此可能对这一复杂系统中的某种组分有了一定的、甚至是比较深入的了解，但是对于这些组分之间的相互作用还知之甚少。
生态农业保护生态环境，没有面源污染 没有健康的生态农业无从谈生态农业。农田中主要害虫和杂草其实都是自然界正常的物种，能够用物理方法干扰控制的，尽量不用化学办法，能够恢复生态平衡，对产量不造成明显影响的，尽量减少人为干预，既节约了人工成本，还保护了农田生态环境。
生态农业存在问题
中国生态农业发展中存在的主要问题： 理论基础上不完备：生态农业作为复杂的系统工程，需要多学科支持，然而以往研究多为单一学科，对系统中各组分有一定了解，但对组分间相互作用了解有限。需进一步从系统、综合角度深入研究，构建生态农业理论体系。
技术体系不够完善 在一个生态农业系统中，往往包含了多种组成成分，这些成分之间具有非常复杂的关系。在一般情况下，农民们并没有足够的理论知识和经验对这一复合系统进行科学的设计，而简单地照搬另一个地方的经验，往往并不能取得成功。
中国生态农业发展面临传统农业思想观念、技术的不完善、缺乏资金以及市场化程度不高的影响。中国农业的历史悠久，中国传统的农业具有刀耕火种、靠天吃饭的特点，自身发展的封闭性和对自然的依赖性使其排斥外部冲击，造成了生态农业推广受阻。
技术体系不够完善，在生态农业实践中，还缺乏技术措施的深入研究，既包括传统技术如何发展，也包括高新技术如何引进等问题。
推广力度不够，虽然生态农业有着悠久的历史，政府也较为重视，但仍然没有在全国范围内得到推广。理论水平不全面，生态农业是一种复杂的系统工程，它需要包括农学、林学、畜牧学、水产养殖、生态学、资源科学、环境科学、加工技术以及社会科学在内的多种学科的支持。
技术体系不够完善：生态农业系统中的各个组成成分之间具有复杂的关系。例如，在鱼塘中饲养鸭子时，需要考虑鸭子的饲养数量，而这将受到水交换速度、水塘容积、水体质量、鱼的品种类型和数量、水温、鸭子的年龄和大小等多种条件的制约。
我国生态农业存在的问题及对策
1、加速生态农业发展的对策措施 加强宣传、提高认识。不断更新观念，把发展生态农业和推进农业可持续发展，增强农业发展后劲提高到战略高度来认识。依靠科技进步，注重高新科技含量。生态农业就是科学技术农业，涵盖了农业的工业化，特别是生物工程技术中的基因工程、细胞工程、生物酶转化工程、发酵工程等等。
2、加强农村生态环境管理监督力度，实行排污制度，严格控制污染物排放。统一监管废水、废气噪声污染、生态建设、生态修复工程等。保护自然资源和野生动植物，实施生态农业建设，确保生物环境安全。对严重生态环境问题及时报告和整改，实施全方位的网络监管活动，完善环境信息化建设。
3、但是，我国的农业也面临着许多问题，如人多地少、土壤肥力下降和环境污染等。要解决这些问题，就必须认真研究农业生态系统的特点，大力发展生态农业。农业生态系统的特点农业生态系统是人类按照自身的需要，用一定的手段来调节农业生物种群和非生物环境间的相互作用，通过合理的能量转化和物质循环，进行农产品生产的生态系统。
4、污水灌溉，土壤退化，农药的使用。污水灌溉是指以经过处理并达到灌溉水质标准要求的污水为水源所进行的灌溉。城市污水，不仅是郊区稻田的重要水源，而且也是重要的肥源。土壤退化，是指在各种自然尤其是人为因素影响下，所发生的不同强度侵蚀而导致土壤质量及农林牧业生产力下降，乃至土壤环境全面恶化的现象。
5、六）农业环境污染 土质退化严重，我国酸雨面积已占国土面积的40%以上；重金属污染面积至少2000万公顷，农药污染面积约1300万至1600万公顷；因固体废弃物堆放而被占用和毁损的农田面积已达200万亩以上，农田退化面积占农地总面积的20%。此外，遗传资源遭到严重破坏。
6、生态农业发展对策 1创新我国农业生态理论与模式 总结国内外正反两方面经验，开展理论与模式创新研究，深化我国生态农业科学研究和保障我国农业可持续发展是非常必要的。
生态农业的优缺点
生态农业的缺点包括： 理论基础上不完备：生态农业作为一种复杂的系统工程，需要多种学科的支持，包括农学、林学、畜牧学、水产养殖、生态学、资源科学、环境科学、加工技术以及社会科学等。 技术体系不够完善：生态农业系统中的各个组成成分之间具有复杂的关系。
缺点：理论基础上不完备：生态农业是一种复杂的系统工程，以前的研究，往往是单一学科的，因此可能对这一复杂系统中的某种组分有了一定的、甚至是比较深入的了解，但是对于这些组分之间的相互作用还知之甚少。
发展生态农业可全面带动农民就业 由于优质优价，加上生态环境优美，对城市人群有很强的吸引力。农业要素容易变成商业要素，从养殖到种植，从收获到加工，从加工到销售，从餐饮到观光旅游，从保健到养生到养老，乡村可以就地城镇化，吸引农二代、大学生二代，乃至城市精英就业。
生态农业模式中的弊端
1、种植密度的不合理 适宜的密度有利于植株的生长。密度过大，引起不良生长，甚至会导致植株整株死亡。种植密度过小，遮阴效果不理想，还减少了土地的利用效率。药物使用的不规范 规模种植业，植物病虫害是难以避免的，应在专业人士的指导下处理。
2、世纪80年代，化肥和农药的过量施用导致生物多样性降低；农业灌溉用水的大幅增加导致水资源匮乏；过度开垦和森林植被破坏、湿地资源破坏、超载过牧等行为导致水土流失以及土壤沙化现象严重。因此，发展生态农业是我国农业发展的迫切需求，生态农业的发展模式在我国开始逐步引入，并且得到了发展。
3、但是随着现代农业的深入发展，其弊端则暴露无遗，比如说加速了自然资源的消耗、污染了土壤环境等等。而生态农业则是在现代农业出现一系列问题之后所产生的新的农业生产模式。
4、生态农业不仅避免了石油农业的某些弊端，如过度依赖化学肥料和农药，而是结合了精耕细作、施用有机肥、间作套种等传统农业的优点。它将有机农业与无机农业相结合，构建了一个庞大的综合系统工程和高效的、复杂的人工生态系统，实现了农业生产体系的现代化和可持续发展。
5、技术体系要不断完善 技术体系不够完善在一个生态农业系统中，往往包含了多种组成成分，这些成分之间具有非常复杂的关系。例如，为了在鱼塘中饲养鸭子，就要考虑鸭子的饲养数量，而鸭子的数量将受到水的交换速度、水塘容积、水体质量、鱼的品种类型和数量、水温、鸭子的年龄和大小等众多条件的制约。